Tujuan utama deteksi antigen Chlamydia trachomatis adalah untuk melihat ada tidaknya infeksi Chlamydia trachomatis. Jika hasil tesnya positif, berarti Chlamydia trachomatis telah terinfeksi. Satu-satunya sel Chlamydia trachomatis yang terinfeksi dalam tubuh manusia adalah sel konjungtiva mata manusia, yang akan menyebabkan produksi trachoma, yaitu sejenis konjungtivitis kronis.